在登记过程中，用户需要先采集指纹，然后计算机系统将自动进行特征提取，提取后的特征将作为模板保存在数据库或其他的地方。在很多场合，用户可能还要输入其他的一些辅助信息，以帮助系统进行匹配，如帐号、用户名等。此过程是一个通用的过程，对所有的生物特征识别技术都适用。有人曾提出用汗腺孔来进行指纹识别，但这种方法要求指纹采集设备要具有非常高的分辨率。所以在实际的系统中没有采用。
指纹识别芯片，就是内嵌的芯片产品，可以实现上述的指纹图像采集、特征提取、对比的芯片。目前智能手机是指纹识别芯片主流的应用终端。但各种识别算法终都归结为在指纹图像上找到并比对指纹的特征。这就是指纹识别技术的基本原理，即采集指纹图像并进行比对指纹特征。然而因为电容式指纹识别拥有体积小、适用性广的优点，指纹门禁一体机，已经有越来越多的设备采用电容式指纹识别，未来的主流将是电容式指纹识别。
总体特征是指那些用人眼直接就可以观察到的特征。端点和分叉点是为常用的特征。通常的算法都要记录它们的位置和方向。但各种识别算法终都归结为在指纹图像上找到并比对指纹的特征。这就是指纹识别技术的基本原理，即采集指纹图像并进行比对指纹特征。多年来，各生物识别技术公司及其研究机构研究了许多指纹识别算法。中心点和三角点在---系统中普遍使用，而在民用系统中并不常用。
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